为加强和改进研究生培养工作，使其结构更合理，更利于培养质量的提高和高层创新人才的脱颖而出，在全国高等医学院校中，北京大学医学部（原北医大）率先改革现行的临床医学专业学位培养制度，统一执行“3＋2”模式。
据北京大学副校长、研究生院院长、医学部主任韩启德院士介绍，北大医学部是全国临床医学专业学位首批试点单位，目前现状是住院医师正规化培训、临床技能研究生培养、七年制学生硕士阶段培养、优秀住院医转博培养等同时存在。各培养轨道分属继续教育学院、研究生院、教育处领导，而在二级单位则分属医务处、教办、科研办等领导，这种情况造成多头领导，政策不一，培养要求不一，互相干扰，管理混乱。这种现状直接影响到临床人才的培养质量及医疗质量。为此，医学部推出“3＋2”培养模式：即纳入合轨培养的人员前3年在二级学科内轮转，达到临床医学专业学位硕士阶段的培养要求；后两年在专科内培养，通过5年全过程培养，达到临床医学博士专业学位水平。
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